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TUhjnbcbe - 2022/11/30 19:49:00
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RAS是人类肿瘤中最先被鉴定出来的致癌基因,也是存在最为广泛的致癌性突变基因之一。一直以来,针对开发抑制RAS驱动性癌症的靶向药物存在诸多困难,因此也被称为“不可成药”靶点。

RAS基因家族目前已知的成员包括KRAS、NRAS和HRAS。其中,年在人类癌症中发现的第一个致癌基因KRAS突变最为常见,大约占85%。KRAS突变类型和概率因肿瘤组织类型而异,大多携带错义突变,包括甘氨酸12(G12)、甘氨酸13(G13)和谷氨酰胺61(Q61)等单氨基酸取代。毫无疑问,面对KRAS这个曾经的“不可成药”靶点,KRASG12C率先被围剿并实现药物上市,而KRASG12D似乎正在成为下一个被围剿的对象。

一“点”不同,两相悲欢

KRAS蛋白由Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(KARS)编码,属于含有个氨基酸的小GTP酶(smallGTPase)。在人类的基因组中,存在2个KRAS基因,包括位于第6号染色体短臂上的“假基因”KRAS1以及位于第12号染色体短臂上的“真基因”KRAS2,只有KRAS2能够转录并且翻译成蛋白,表现生物学活性。

KRAS蛋白通过响应细胞外信号,在结合GTP的激活状态(ON)与结合GDP的失活状态(OFF)之间循环转换,保持正常的生物功能。发生突变的KRAS蛋白,GAP进入GTP受限从而阻止水解,形成持续激活的GTP结合状态。KRAS活性因此也变得独立于细胞外刺激,导致下游通路的过度刺激和细胞增殖、迁移以及转移信号的诱导,表现为促进癌细胞的增殖、存活和转移。

NatRevDrugDiscov.Aug;19(8):-

由于突变型KRAS对三磷酸鸟苷(GTP)具有较高的亲和力,又存在催化位点小、蛋白表面光滑等难以靶向的因素,使小分子抑制剂的开发一直备受挑战,造就了KRAS的“不可成药”传奇。因此,既然不能实现直接特异性靶向KRAS,研究人员也只好针对上下游级联通路中的靶标,间接靶向KRAS。FDA也先后批准了多个级联通路上的靶标药物。

不过,科学家并未退却。凭借KRASG12C突变新引入的半胱氨酸易形成共价键的特性,设计了能够不可逆地靶向结合KRAS12号密码子上半胱氨酸残基的共价小分子抑制剂,最终实现药物上市,第一次成功的“围剿”了KRASG12C突变蛋白。如今,面对同一密码子又显示相似的局面。

KRASG12D相对于KRASG12C,仅是同一个密码子上氨基酸突变种类不同。这一“点”不同,再次造成两项差异和悲欢。首先,KRASG12D是KRAS12号密码子突变引入天冬氨酸,而不是半胱氨酸,直接表现为流行病学上的差异。通常认为,在恶性肿瘤中KRAS突变发生率约30%,不过在不同的瘤种中比例也有所差异。

CellRepMed.Jan19;2(1):

KRAS在胰腺癌中发生比例最高,而胰腺癌又俗称“癌中之王”,本身治疗手段有限。相较于KRASG12C主要集中在肺癌领域,这一“点”不同将KRASG12D的优势领域聚焦在胰腺癌。区别于KRASG12C在肺癌领域的发生比例,KRASG12D在胰腺癌中也是高出了一个数量级,更加说明开发KRASG12D抑制剂的紧迫性。

MiratiTherapeutics(下同)

其次,KRASG12D与KRASG12C的这一“点”不同,又直接导致KRASG12C的抑制剂药物无法直接用于治疗KRASG12D突变肿瘤,毕竟天冬氨酸无法与KRASG12C抑制剂形成共价结合,这无疑是悲。不过,得益于在KRASG12C抑制剂药物的开发经验,又为KRASG12D药物的开发提供了先导化合物,使开发KRASG12D药物成为可能,总算也是一件好事。

正是KRASG12C和KRASG12D这一“点”差异和联系,参考KRASG12C抑制剂药物的开发现状,KRASG12D或将成为下一个被围剿的“不可成药”靶标。毕竟,MiratiTherapeutics和安进公司都已经显示了这方面布局迹象。

注:公司仅列出全球和中国区权利所有人

MRTX:首个公布临床前数据的KRASG12D抑制剂

MRTX是MiratiTherapeutics在Adagrasib基础上,采用吡啶并[4,3-d]嘧啶骨架进一步筛选和优化得到的一款选择性非共价KRASG12D抑制剂,相关专利也已经公开(WO041671)。

概括来说,Mirati通过对吡啶并[4,3-d]嘧啶的2、4、7三个位置取代基团进行筛选,以提高活性和选择性。首先,4位(R4)取代基的选择主要是强化与Gly60和Asp12的相互作用(氢键);2位(R2)取代基最终选择的基团能够与Glu62形成强盐桥相互作用和可能的非经典C-H-O氢键,卤素(F)取代的加入增加这两种作用;7位主要涉及萘基取代基的优化,增加了非经典的C-H-O氢键和经典氢键等相互作用。

吡啶并[4,3-d]嘧啶骨架3个取代位置的优化,提高了MRTX的整体结合力活性和选择性。此外,不同于当前上市和临床KRASG12C抑制剂,MRTX实现了同时抑制活性和非活性的KRASG12D蛋白,有望提供更高效的靶标抑制作用。

体外模型中,MRTX也显示了高效抑制活性和强大的抗肿瘤作用。在多种胰腺癌细胞移植模型中,MRTX不仅具备有效的单药活性,也表现出潜在的联合用药趋势。

国内企业:谁来围剿KRASG12D

目前,国内企业仅加科思公开宣布KRASG12D抑制剂(JAB-)的研发进展。不过,按照Mirati公司KRASG12D抑制剂MRTX的开发思路和安进公司的专利布局,国内KRASG12C抑制剂开发企业也有转战围剿KRASG12D的机会,加科思便是实例。

当然,国内已经有KRASG12C抑制剂开发经验的企业是否参与到KRASG12D的围剿,仍有待观察。据悉,近期已有国内企业提交KRASG12D抑制剂的IND申请,预示着国内企业围剿KRASG12D之战或将正式开始。

注:仅统计国内公司信息

另外,使用“KRASG12Cinhibitor”经Scifinder检索,国内有33家企业或机构(不含隶属的子、分公司)分别提交了72件KRASG12C领域的专利申请。不过,目前国内KRASG12D的专利布局则主要是检测和模型领域,暂无国内企业或个人申请的小分子KRASG12D抑制剂专利公开。

然而,相较于是否参与到KRASG12D的围剿,国内企业恐怕更重要的是考虑如何构建自身的优势壁垒,避免在围剿KRASG12D的同时,成为被“围剿”的对象。当同类机制药物实现了2~3个临床使用时,跟随者将面临微小空间和巨大竞争,因此药物的临床优势和差异将至关重要,而如何实现这样的壁垒,也需要各家企业深入发掘。

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